7日,記者從中國林業(yè)科學(xué)研究院獲悉,該院日前在《自然·通訊》雜志在線發(fā)表重要成果:成功構(gòu)建全球首個染色體級別的高質(zhì)量山蒼子基因組圖譜,并基于此揭示樟科物種進(jìn)化及其精油合成的分子機(jī)制。
山蒼子是我國南方家喻戶曉的一種香樹。2016年10月,中國林業(yè)科學(xué)研究院亞林所研究團(tuán)隊啟動了山蒼子基因組測序項目,經(jīng)過3年多努力完成項目,獲得了大小為1.37G、片段重疊群N50為607.34Kb的基因組。通過Hi-C技術(shù),他們進(jìn)一步將基因組錨定到24條染色體上,錨定率94.56%,獲得質(zhì)量優(yōu)良的山蒼子基因組圖譜。
中國科學(xué)院院士、中國水稻研究所研究員錢前評價:“目前,對樟科植物果實(shí)精油及精油主要成分單萜化合物的生物合成機(jī)理尚不清楚,制約了樟科植物精準(zhǔn)育種。林科院汪陽東團(tuán)隊選擇樟科果實(shí)精油含量最豐富的物種——山蒼子為研究對象,構(gòu)建了山蒼子全基因組圖譜,并結(jié)合樟科20屬47代表種低蓋度基因組測序數(shù)據(jù)和16屬23代表種混合組織及花苞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù),揭示了單萜合酶基因家族在樟科中的演化,有效促進(jìn)了樟科植物單萜化合物多樣性和特異性,對揭示樟科植物的生物學(xué)特性、指導(dǎo)樟科遺傳育種研究特別是加速分子育種進(jìn)程具有指導(dǎo)作用。”
據(jù)悉,中國林科院亞林所副研究員陳益存、博士趙耘霄、助理研究員高暝,比利時根特大學(xué)博士后李臻,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)博士王潔雨,清華大學(xué)博士劉可為是論文共同第一作者;中國林科院亞林所研究員汪陽東、臺灣成功大學(xué)教授蔡文杰、福建農(nóng)林大學(xué)教授劉仲健、根特大學(xué)教授Yves為共同通訊作者。(記者馬愛平 通訊員宋平 王舒琦)
關(guān)鍵詞: 山蒼子基因組圖譜